《指导意见》系统构建了畜禽粪污的收集、处理、利用和检测等资源化利用全链条标准体系，涵盖综合通用、无害化处理、粪肥利用、气体管控和检测方法等5个子体系，按照术语、技术、工艺、设备、方法、安全等进一步细分，形成了15个分支体系。
《指导意见》提出了标准制修订工作的重点。在综合通用方面，主要包括管理术语、畜禽粪污产生量、粪污特性、粪污综合利用评价等基础共性标准，是畜禽粪污资源化利用标准体系的基础支撑。在无害化处理方面，主要包括粪污处理技术规范、设施装备设计要求及安全生产要求等标准，重点是推动畜禽粪污有效处理等相关标准的制修订。在粪肥利用方面，主要包括粪肥限量指标、技术指标和施用技术等标准，重点是推动畜禽粪肥科学有效还田利用、基质化利用等相关标准的制修订。在气体管控方面，主要包括温室气体和恶臭气体的减排技术规范、核算核证等标准，重点是推动畜牧业减少气体排放、科学计量气体排放总量等相关标准的制修订。在检测方法方面，主要包括畜禽粪污的采样和测定方法等标准，重点是推进畜禽粪污、畜禽粪肥和排放气体的成分检测等相关标准的制修订。
《指导意见》明确了畜禽粪污资源化利用标准化工作重点任务，提出了组织实施的保障措施，积极引导科研院所、社会团体和企业加快推进相关标准的制修订，持续提升畜禽粪污资源化利用水平。
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